Kuplerne er styret af et stort klimaanlæg med et separat system til hver af kuplerne. Hver kuppel er desuden opdelt i tre klimazoner; top, midt og bund. Der er opsat målebokse i hver af disse zoner og klimacomputeren modtager oplysninger om den aktuelle temperatur og luftfugtighed hver 5. minut fra disse bokse. Klimacomputeren får desuden information om solintensitet, vindstyrke, vindretning, temperatur og luftfugtighed fra en klimastation placeret uden for kuplerne. Ved at sammenholde med de ønsker til klimaet vi har indtastet i computeren, styrer computeren, om der skal tændes eller slukkes for varmen, om der skal åbnes eller lukkes for vinduerne, om der skal tændes eller slukkes for lyset i kuplerne og om der skal tændes eller slukkes for befugtigningssystemet.

Om vinteren er det nødvendigt at opvarme kuplerne. Varmerørene ligger som store ringe i tre niveauer i hver kuppel. Det laveste niveau er på overgangen mellem betonmuren og selve kuplen og de to andre niveauer er i selve kuppelkonstruktionen. Varmerørene fungerer som almindelige radiatorer, hvor der løber varmt vand igennem. Klimacomputeren regulerer varmetilførslen til rørene.

I vinterperioden er det ikke blot nødvendigt at opvarme kuplerne. Der skal også være kunstbelysning for at planterne kan overleve den mørke vinter. Til det formål er der alene i Sydamerikakuplen opsat 100 lamper, der kan lyse med 780 watt hver. Det svarer til næsten 40 watt pr. m2 i kuplen. Det er cirka fire gange så mange watt pr. m2 som i et godt oplyst kontorlokale.

Om natten regner det i alle tre kupler. Vandet som falder ned over planterne i kuplerne er opsamlet regnvand fra kuplernes tag. Det store kunstige brætrodstræ i Asienkuplen er en stor regnvandsbeholder ligesom der ligger en stor regnvandsbeholder under Mayatemplet i Sydamerikakuplen.