I forbindelse med opførelsen af en ny stor kuppel til dyr og planter fra den sydamerikanske regnskov, blev hovedindgang, café og butik flyttet og kraftig udvidet i 2002. Det gamle indgangsparti blev samtidigt ombygget til madpakkeområde og skoletjenestelokale.
I 2003 åbnede Sydamerikakuplen. Kuplen er på 2000 m2 og dermed mere end dobbelt så stor som de to oprindelige kupler tilsammen.
I 2005 åbnede Regnskovens saltvandsakvarie, med et stort antal fisk fra Caribien. I samme år blev Afrikakuplen renoveret og ombygget, så det bl.a. blev muligt at se colobusaber i et nyt stort anlæg.
Fra 2006 fik gæsterne mulighed for at vandre i højde med trætoppene med Treetop walking.
